Paola Malatesta, moglie di Gianfrancesco Gonzaga (5° capitano del popolo a Mantova), fece costruire la chiesa con l'annesso monastero dedicato al Corpo e Cristo all'inizio del XV secolo per ospitare le clarisse francescane. Anche la costruzione del chiostro fu completata da Luca Fancelli, architetto ducale. Suor Livia Paola Gonzaga era la figlia della marchesa Isabella dEste, priora del monastero. Fece affrescare la chiesa dopo la sepoltura di sua madre grazie a Federico II Gonzaga suo fratello, marchese di Mantova. Giulio Romano, marchese di Mantova, fu coinvolto nei lavori. Egli dipinse la scena del funerale di Federico II. Fu sede di una caserma oltre che di una fabbrica dalla fine del XVIII secolo fino alla fine del 50. Oggi, la scuola di restauro si trova nel lex-convento. Anche Isabella dEste, il pantheon dei Gonzaga, è sepolta qui.

La scuola è stata utilizzata per la formazione professionale. Può essere visitata solo su richiesta. La chiesa fu costruita nel 1400 e utilizzata come Pantheon della famiglia Gonzaga.

Il figlio primogenito di Isabella dEste fu sepolto qui un anno dopo. La chiesa è meravigliosa ma non molto apprezzata.