Santa Maria dellImperiale si trovava lungo la via Flaminia e apparteneva alla Comunità delle Madri Crocifere dello Spirito Santo. Ce l'avevano dal XIII secolo. Erano quelli che ospitavano i pellegrini che non potevano entrare in città di notte. Per questo il nome di Santa Maria delle fabbricole fu dato alle casette dove vivevano i pellegrini. Il PP fu istituito nel 1610 dal duca Francesco Maria II Della Rovere. Crociferi diede la chiesa a un prete rurale. Dopo la soppressione (1636) del loro ordine, l'ospedale e la chiesa furono resi commenda. L'ospedale fu chiuso dopo la caduta della Signoria, e il ritorno di Pesaro dalla Santa Sede. Una bolla di Papa Clemente XII (1730-40) dichiarò la chiesa "Cappellania Curata". Tuttavia, rimase sotto il controllo della parrocchia di Roncaglia. Dal vescovo Filippo Spada, la chiesa fu risistemata, ingrandita e la loggia fu demolita nel l740. Alla fine del XVIII secolo era ancora angusta e inadeguata alle esigenze della popolazione locale. Il conte Giovan Francesco almerici la ricostruì da zero nel 1801-05 nella forma attuale. Fu costruita da monsignor Giuseppe Beni come chiesa parrocchiale.