Il museo ha esempi di architettura dorica, come il Tempio Y, un tempio di dislocazione sconosciuta, che ora è montato in fondo alla sala, incorniciato da archi. Il Museo Archeologico del Baglio Florio si trova all'interno del Parco Archeologico di Selinunte ed era la sede di una delle attività imprenditoriali della famiglia Florio.