Il primo restauro dell'oratorio fu fatto nel 1540 da Bartolomeo Solari. È un discendente di uno dei più importanti proprietari terrieri di San Marco. Nel 1663, la collezione da lui agevolata fu trasferita per l'ampliamento della cappella primitiva. Gli anni settanta del secolo scorso videro un significativo ampliamento di questa chiesa e la creazione adiacente ad essa. Carlo Del Bono, amministratore della Comunità Borgomanerese, seguì liberamente la costruzione e i lavori del campanile. Fu dedicato solennemente il giorno della festa di San Marco nel 1874.