Gundiperga, moglie del re Rotari, fondò una delle più antiche chiese di Pavia. Si tratta della chiesa di San Giovanni Domnarum. Il nome, che significa "delle donne", è un riferimento alla presenza all'interno di un fonte battesimale che era esclusivamente femminile. Accanto ai capitelli corinzi di epoca tardo antica, si trovano altri capitelli con foglie angolari dell'VIII secolo. Gli affreschi sono del XII secolo.

Bellissimi affreschi trovati nella cripta, che sono stati scoperti nel 1914, sono una rappresentazione di santi di interesse locale San Siro (secondo vescovo di Pavia) e SantInvenzio ("secondo vescovo di Pavia") rispettivamente. C'è anche Sa Gregorio Magno, e scene della vita di Giovanni Battista.

La chiesa di San Giovanni in Domnarum è una delle più antiche di Pavia ed è parte di un più ampio complesso alto medievalecomprendente la chiesa stessa, il campanile e la cripta.[1] Si trova nel pieno del centro storico, in via Mascheroni, a pochi passi dalla chiesa del Carmine con la facciata inglobata in un complesso abitativo e lingresso allinterno di un cortile. Nella cripta, che è stata riscoperta dopo secoli nel 1914, sono visibili dei resti di affreschi.La chiesa fu fondata intorno allanno 654[2]per volere di Gundeperga, moglie di Roari e Arioaldo e figlia della regina Teodolinda e di Agilulfo per accogliervi la sua sepoltura o per essere sede del fonte battesimale delle femmine, da cui lintitolazione a San Giovanni Battista e la specificazione domnarum (ossia delle donne)[1].Si tratta probabilmente del primo edificio di culto cattolico eretto dai re longobardi nella città di Pavia[3]. La chiesa ebbe un ruolo di preminenza nel panorama cittadino fino a circa lanno Mille, anche grazie alla dotazione patrimoniale che le era stata assegnata dalla fondatrice.Per la chiesa furono emanati tra IX e X secolo una copiosa serie di diplomi imperiali, in cui si menziona la fondazione di Gundiperga, mentre in un atto del vescovo di Pavia Bernardo I del 1129 sono attestate le messe pro anima della regina Gundiperga che ancora venivano celebrate nella chiesa [4].In base ad alcuni ritrovamenti è stato ipotizzato che il luogo ospitasse un edificio termale di epoca romana[5]. Questa preesistenza potrebbe spiegare alcune irregolarità della pianta sia della chiesa che della cripta.Nel XVII secolo il prevosto Torriani ricostruì interamente la chiesa seguendo i dettami della Controriforma e demolendo quasi interamente le sussistenze precedenti.